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Revista de la Sociedad Venezolana de Microbiología

versión impresa ISSN 1315-2556

Rev. Soc. Ven. Microbiol. vol.32 no.2 Caracas dic. 2012

 

Epidemiología molecular de Klebsiella pneumoniae productora de β-lactamasas de espectro extendido

Rosa María Tedesco-Maiullaria,b, Armando Guevarab,c,*

aPostgrado en Ciencias Médicas Fundamentales. Facultad de Medicina. Universidad de Los Andes. Mérida. Venezuela.

bDepartamento de Parasitología y Microbiología. Escuela de Ciencias de la Salud “Dr. Francisco Battistini”. Universidad de Oriente. Ciudad Bolívar. Venezuela.

cLaboratorio de Resistencia Bacteriana. Instituto de Investigaciones en Biomedicina y Ciencias Aplicadas. Universidad de Oriente. Venezuela.

 * Correspondencia: E-mail: agvillefort@yahoo.com

Resumen: La rápida emergencia de la resistencia antimicrobiana debida a las betalactamasas de espectro extendido (BLEE) tiene un impacto clínico significativo, lo cual se considera un problema de salud pública. El objetivo de este estudio fue determinar si existe diseminación clonal de K. pneumoniae productora de BLEE, en pacientes adultos hospitalizados en el Complejo Hospitalario “Ruiz y Páez” (CHRP), Ciudad Bolívar, Venezuela. Se evaluaron 13 cepas de K. pneumoniae aisladas de pacientes adultos con infección intrahospitalaria. La confirmación fenotípica de la producción de BLEE, fue realizada por los métodos de sinergia de doble disco y del disco combinado. Se realizó la tipificación molecular de los aislados mediante electroforesis de campo pulsante (ECP). Todas las cepas presentaron resistencia asociada a las fluoroquinolonas y 9 fueron resistentes a los aminoglucósidos. Se encontraron 12 fenotipos de susceptibilidad; el fenotipo I prevaleció en dos cepas. La ECP reveló que la mayoría de las cepas presentaron pulsotipos distintos, descartando una posible relación clonal entre ellas, a excepción de dos aislados que presentaron pulsotipos indistinguibles entre sí, ambos del mismo servicio de hospitalización. Se puede concluir que en el CHRP para el período marzo-junio de 2011, no hubo diseminación clonal de K. pneumoniae productoras de BLEE.

Palabras clave: Klebsiella pneumoniae, betalactamasas de espectro extendido, electroforesis de campo pulsante.

Molecular epidemiology of extended spectrum β-lactamases producing Klebsiella pneumoniae

Abstract: The rapid emergence of antimicrobial resistance to extended spectrum β-lactamases (ESBL) has a significant clinical impact, and is considered a public health problem. The purpose of this study was to determine if there is clonal dissemination of ESBL producer K. pneumonia in adult patients hospitalized at the Complejo Hospitalario “Ruiz y Paez” (CHRP) of Ciudad Bolivar, Venezuela. Thirteen K. pneumoniae strains isolated from adult patients with intra-hospital infections were evaluated. The phenotypic confirmation of ESBL production was done with the double disk synergy and combined disk methods. The molecular typing of the isolates was done through pulse field electrophoresis (PFE). All the strains presented fluoroquinolone-associated resistance and 9 were aminoglucoside resistant. Twelve susceptibility phenotypes were found; phenotype I prevailed in 2 strains. PFE revealed that most of the strains presented different pulsetypes, discarding a possible clonal relationship among them, except for 2 isolates which presented undistinguishable pulsetypes, both from the same hospitalization service. It can be concluded that at the CHRP there was no clonal dissemination of ESBL producer K. pneumoniae during the March-June 2011 period.

Keywords: Klebsiella pneumoniae, extended spectrum β-lactamase, pulse field electrophoresis.

Recibido 24 de febrero de 2012; aceptado 5 de junio de 2012

Introducción

La rápida emergencia de la resistencia antimicrobiana debida a las betalactamasas de espectro extendido (BLEE) tiene un impacto clínico significativo y actualmente es motivo de preocupación, por lo cual se considera un problema de salud pública. Las BLEE son enzimas que producen los bacilos gramnegativos y confieren resistencia a las penicilinas, a todas las cefalosporinas y al aztreonam, pero no a los carbapenemos ni a las cefamicinas y la mayoría son inhibidas por el ácido clavulánico [1-6]. Se ha descrito que la administración indiscriminada de cefalosporinas de tercera generación, particularmente ceftazidima, es una de las principales causas de la aparición de enterobacterias productoras de BLEE, que han ocasionado brotes de infección, con resistencia a múltiples antibióticos, especialmente en las Unidades de Cuidados Intensivos (UCI), dificultando el tratamiento y aumentando la morbimortalidad asociada a los cuidados de la salud [3,7,8].

Las principales enterobacterias productoras de BLEE son Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli. La frecuencia de este tipo de enzima en estas especies bacterianas es variable, con un predominio en casi todas las regiones de K. pneumoniae; sin embargo, existen regiones del mundo, e incluso países, donde la producción de BLEE es más frecuente en E. coli. En Europa, la producción de BLEE se observa principalmente en K. pneumoniae (22,6%) [9,10], mientras que en Asia se presenta más frecuentemente en E. coli con 67% seguida de K. pneumoniae con un 55% [11]. En Latinoamérica, la frecuencia de BLEE en K. pneumoniae y E. coli es variable entre los distintos países. Para K. pneumoniae oscila entre 36 a 56% mientras que para E. coli es de 8,5 a 31% [9,10,12-15].

K. pneumoniae es considerada una especie patógena oportunista para el hombre. A partir de 1998 en Venezuela y América Latina se ubica entre los principales patógenos causantes de infecciones intrahospitalarias. La presencia de mecanismos de resistencia, como producción de enzimas BLEE (tipo SHV, TEM, CTX-M entre otras), enzimas modificadoras de aminoglucósidos, cloranfenicol-acetiltransferasas y proteínas protectoras del sitio blanco de las topoisomerasas (Qnr), han originado fallas terapéuticas en el tratamiento de las infecciones causada por K. pneumoniae [4,6].

K. pneumoniae productora de BLEE podría diseminarse de forma epidémica en áreas de riesgo; en estos casos la diseminación habitualmente es clonal y los factores para adquirir infección por esta bacteria están muy relacionados con la comorbilidad del paciente, las manipulaciones diagnósticas o terapéuticas y el uso de antibióticos [8,16].

Por razones que no son bien conocidas, K. pneumoniae es más prevalente en los hospitales, causando brotes epidémicos en las UCI, o como un patógeno endémico en las áreas quirúrgicas [7,17]. La presión antibiótica selectiva, sobre todo con cefalosporinas de tercera generación, ha sido señalada como factor desencadenante de brotes epidémicos producidos por K. pneumoniae productoras de BLEE y del mantenimiento de situaciones de endemia elevada [17]; además, K. pneumoniae es el microorganismo productor de BLEE descrito con más frecuencia, probablemente relacionado con el hecho de que esta especie forma parte de la flora normal, sobrevive durante largos períodos de tiempo sobre la piel y los fómites y adquiere, con cierta facilidad, plásmidos conjugativos, que en la mayoría de los casos, portan genes que codifican resistencia para múltiples antimicrobianos altamente estables [3,7,8]. En muchas oportunidades, los brotes epidémicos y las endemias por enterobacterias productoras de BLEE son ocasionadas por una cepa clonal o por un único plásmido. Esto es más evidente en K. pneumoniae productora de BLEE, que puede diseminarse entre hospitales o áreas sanitarias; en cualquier caso, esta situación también se ha descrito en E. coli productoras de BLEE [1,18].

La alta prevalencia de BLEE en K. pneumoniae sugiere restringir el uso de antibióticos betalactámicos de amplio espectro e implementar medidas rigurosas de higiene para el control de las infecciones y la prevención de la diseminación de microorganismos productores de BLEE en el ambiente hospitalario. Por tal motivo, esta investigación tuvo como objetivo determinar si existe diseminación clonal de K.pneumoniae productora de BLEE entre pacientes adultos hospitalizados en el Complejo Hospitalario “Ruiz y Páez” de Ciudad Bolívar, Venezuela.

Materiales y métodos

Aislamientos bacterianos: Se analizaron 13 cepas de K. pneumoniae productoras de BLEE, aisladas de pacientes adultos con infecciones asociadas a los cuidados de salud, recluidos en diferentes servicios del Complejo Hospitalario “Ruiz y Páez” en Ciudad Bolívar, estado Bolívar, Venezuela, durante el período marzo-junio de 2011. Las características clínico-epidemiológicas de los pacientes con infección por K. pneumoniae se muestran en la tabla 1.

Tabla 1. Características epidemiológicas de los pacientes con infecciones por K. pneumoniae productora de BLEE asociadas a los cuidados de la salud. Complejo Hospitalario “Ruiz y Páez” (CHRP), Ciudad Bolívar, Venezuela.

Nº de cepa

Edad del paciente (años)

Sexo

Servicio Hospitalario

Diagnóstico clínico

11-A

54

F

Medicina II

Infección de herida operatoria

347-A

63

M

Medicina I

Infección de herida traumática

133-A

52

M

Medicina I

Pie diabético

575-O

53

M

Medicina I

Infección urinaria

420-O

42

M

Medicina I

Infección urinaria

62-A

19

M

Medicina I

Sepsis

349-A

24

F

Cirugía II

Infección de herida operatoria

231-A

16

F

Cirugía II

Quemaduras de 2do y 3er grado

205-A

46

M

UCI

Neumonía asociada a ventilación mecánica

244-B

64

M

UCI

Neumonía asociada a ventilación mecánica

189-A

29

F

E/A

Celulitis de mano izquierda

61-A

45

M

E/A

Infección de herida operatoria

350-A

19

F

E/A

Infección de herida operatoria

UCI: Unidad de cuidados intensivos. E/A: Emergencia de adultos.

Susceptibilidad antimicrobiana: Las pruebas de susceptibilidad a los antimicrobianos se llevaron a cabo mediante el método de difusión con discos, siguiendo los lineamientos para enterobacterias del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) 2011 [19]. Se ensayaron los siguientes antimicrobianos: amoxicilina/ácido clavulánico (20/10µg), piperacilina/tazobactam (100/10µg), ceftazidima (30µg), cefotaxima (30µg), cefoperazona (75µg), cefepima (30µg), imipinem (10µg), meropenem (10µg), aztreonam (30µg), amikacina (30µg), gentamicina (10µg), ácido nalidíxico (30µg), ciprofloxacina (5µg), levofloxacina (5µg).

Detección fenotípica de BLEE: Se realizó la confirmación fenotípica de la producción de BLEE, a todas las cepas de K. pneumoniae, mediante el método de sinergia de doble disco, y por el método del disco combinado [20,21].

Tipificación molecular de los aislados de K. pneumoniae: Se realizó la tipificación molecular de los aislados mediante la electroforesis de campo pulsante (ECP) en el equipo Guefast-06® (NEURONIC, S.A).

Preparación del ADN inmovilizado: Las cepas de K. pneumoniae fueron subcultivadas en agar Müeller-Hinton (BBL®), luego fueron recolectadas, lavadas con una solución de NaCl al 0,5% y EDTA al 0,01M pH 8,0; posteriormente, se suspendieron en 50 µL de la solución de lavado, se mezclaron con 150 µL de agarosa de bajo punto de fusión al 1,5%, fundida y estabilizada a 45 ºC. Utilizando el molde para la fabricación de bloques, se prepararon minibloques de 3 x 3 x 0,7 mm. La concentración final de células bacterianas en cada minibloque fue de 2,1 x 109 células/mL aproximadamente. Posteriormente, las células inmovilizadas fueron sometidas a un proceso de lisis y desproteinización, colocándolas en una solución que contenía Tris AL 0,01M; EDTA al 0,1M; sarcosyl al 1%; 1% nonident P40 al 1% y urea al 4M pH 9,5. Se incubaron por 2 horas a 45 ºC, luego se eliminó esta solución, se lavaron con agua destilada y con una solución Tris-HCL al 0,01M; EDTA al 0,1M pH 8, donde se conservaron a 4 ºC hasta el momento de la digestión [22].

Digestión del ADN inmovilizado con enzimas de restricción: Un minibloque de cada aislado en estudio fue lavado tres veces con la solución 0,01M Tris-HCL y 0,05M EDTA pH 8 a temperatura ambiente por 10 minutos, luego fueron incubados con 100 μL de tampón de digestión SH 1X de la enzima, proporcionado por el fabricante (Sigma®) a temperatura ambiente por 10 minutos. Posteriormente, fueron transferidos a 100 μL de tampón de digestión recién preparado y se colocó 1 µL de la enzima de restricción XbaI (Sigma®). Se incubó durante 2 horas a 37 ºC. La reacción se detuvo reemplazando el tampón por 1 mL de Tris-HCL al 0,01 M; EDTA al 0,1M pH 8 [22].

Separación de los fragmentos de macrorrestricción del ADN de K. pneumoniae: La electroforesis se realizó en la cámara minichef del equipo Guefast-06® (NEURONIC, S.A). Los fragmentos de ADN fueron separados en un campo eléctrico de 10 V/cm durante 5 horas, 20 minutos en un gel de agarosa al 1,5% de 7 x 5 x 0,5 cm sumergido en tampón de electroforesis TBE 0,5X. Posteriormente, el gel se coloreó con bromuro de etidio (Sigma-Aldrich®), se visualizó en un transiluminador UV y se fotografió con una cámara digital PowerShot A700 (Canon®).

El análisis de los perfiles obtenidos por ECP y la construcción del dendograma fueron realizados mediante análisis computarizado, utilizando el software GuefaScan® (NEURONIC S.A.), acorde con el coeficiente de similitud de Dice y el algoritmo UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Averages). Las cepas que presentaron índice de similitud igual o mayor al 80% se consideraron clonalmente relacionadas.

Resultados

Al realizar las pruebas de susceptibilidad a los 13 aislados de K. pneumoniae, provenientes de pacientes adultos con infecciones asociadas a los cuidados de salud, se encontró que presentaron 12 fenotipos; el fenotipo I prevaleció en dos de ellas. Así mismo, se pudo corroborar la producción de BLEE por los métodos de sinergia de doble disco y del disco combinado; además se encontró que todas las cepas presentaron resistencia asociada a las fluoroquinolonas y 9 aislados fueron resistentes a los aminoglucósidos (Tabla 2).

Tabla 2. Fenotipos de susceptibilidad de K. pneumoniae productoras de BLEE. Complejo Hospitalario “Ruiz y Páez” (CHRP), Ciudad Bolívar, Venezuela.

Fenotipo

Antibiotipos

Nº de aislados

I

AMC(I), TZP(I), CAZ(R), CFP(R), CTX(R), FEP(R), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(R), AK(R), NA(R), CIP(R), LVX(R)

2

II

AMC(I), TPZ(I), CAZ(R), CFP(R), CTX(R), FEP(I), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(R), AK(S), NA(R), CIP(R), LVX( R)

1

III

AMC(R), TZP(R), CAZ(R), CFP(R), CTX(R), FEP(S), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(S), AK(S), NA(I), CIP(R), LVX(S)

1

IV

AMC(R), TZP(R), CAZ(R), CFP(I), CTX(R), FEP(R), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(R), AK(S), NA(R), CIP(R), LVX(R)

1

V

AMC(I), TZP(I), CAZ(R), CFP(R), CTX(R), FEP(I), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(R), AK(R), NA(R), CIP(R), LVX(S)

1

VI

AMC(I), TZP(S)CAZ(R), CFP(I), CTX(R), FEP(R), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(R), AK(R), NA(R), CIP(R), LVX(R)

1

VII

AMC(S), TZP(S), CAZ(R), CFP(R), CTX(R), FEP(S), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(R), AK(R), NA(R), CIP(I), LVX(S)

1

VIII

AMC(I), TZP(I), CAZ(R), CFP(I), CTX(R), FEP(S ), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(R), AK(R), NA(R), CIP(S), LVX(S)

1

IX

AMC(S), TZP(S), CAZ(R), CFP(R), CTX(S), FEP(S), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(S), AK(S), NA(R), CIP(S), LVX(S)

1

X

AMC(I), TZP(I), CAZ(R), CFP(I), CTX(S), FEP(S), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(R), AK(R), NA(R), CIP(R), LVX(R)

1

XI

AMC(R), TZP(I), CAZ(R), CFP(R), CTX(R), FEP(R), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(S), AK(I), NA(S), CIP(R), LVX(S)

1

XII

AMC(S), TZP(S), CAZ(R), CFP(I), CTX(R), FEP(S), IPM(S), MEM(S), ATM(R), GM(S), AK(R), NA(I), CIP(S), LVX(S)

1

AMC: amoxicilina/ácido clavulánico, TZP: piperacilina/tazobactan, CAZ: ceftazidima, CFP: cefoperazona, CTX: cefotaxima, FEP: cefepima, IPM: imipinem, MEM: meropenem, ATM: aztreonam, GM: gentamicina, AK: amikacina, NA: ácido nalidíxico, CIP: ciprofloxacina, LVX: levofloxacina, S: sensible, I: intermedio, R: resistente.

En la tipificación molecular mediante la ECP se encontró que la mayoría de las cepas presentaron patrones de bandas (pulsotipos) totalmente distintos, por lo que los porcentajes de similitud fueron bajos (menor al 80%), con excepción de dos aislados (420-O y 133-A) que presentaron patrones de bandas indistinguibles entre sí y el mismo fenotipo de susceptibilidad (fenotipo I); ambas cepas fueron aisladas del servicio de Medicina I (Figuras 1 y 2).

Discusión

La producción de BLEE representa en los actuales momentos un problema de salud pública en el ámbito mundial. Desde la descripción de la primera enterobacteria productora de BLEE en 1983, estos microorganismos han sido reportados progresivamente en todo el mundo, siendo relacionados, en sus inicios, a las infecciones asociadas a los cuidados de la salud, pero con una presencia cada vez más importante en la comunidad, posiblemente por el uso generalizado de cefalosporinas de amplio espectro [3,4,8,23,24]. Para el estudio de las infecciones asociadas a los cuidados de la salud, es indispensable la aplicación de técnicas y marcadores de epidemiología molecular, sobre todo en hospitales en los que se dispone de unidades de cuidados intensivos, neonatología, unidad de quemados u oncología, en donde ingresan pacientes susceptibles de adquirir infecciones graves [8]. La genotipificación, permite determinar si un grupo de cepas de una especie en particular tienen un origen clonal, es decir, si provienen de un precursor común. Estas técnicas de tipificación molecular han permitido detectar el origen y la ruta de epidemias hospitalarias, así como definir estrategias de control y eliminación de la infección [7]; incluyen la macrorrestricción de ADN cromosómico, siendo la ECP una de las más utilizadas debido a que presenta gran versatilidad y permite conocer la clonalidad de diferentes aislados en situaciones epidémicas con tiempo y espacio definido [8].

La multirresistencia en microorganismos productores de BLEE es en la actualidad uno de los principales problemas en los hospitales de Latinoamérica y el mundo, debido a que disminuyen las opciones de tratamiento antimicrobiano [13]. Al analizar los patrones de susceptibilidad antimicrobiana obtenidos en los aislados de K. pneumoniae productoras de BLEE, se pudo comprobar que, además de la resistencia a los betalactámicos, existe una alta frecuencia de resistencia asociada a los aminoglucósidos y fluoroquinolonas en la mayoría de las cepas estudiadas; esto también ha sido reportado por otros autores [8,25-27]. La resistencia asociada a otros antibióticos está dada por la transferencia de plásmidos entre diferentes cepas bacterianas, que además de portar genes que codifican para las betalactamasas de espectro extendido, también portan genes que codifican para otros mecanismos de resistencia, producto de la alta presión selectiva ejercida por la mala utilización de cefalosporinas de tercera generación, principalmente de ceftazidima [8,25-27].

Al evaluar los patrones de bandas obtenidos en la ECP, se pudo observar, que la mayoría de las cepas de K. pneumoniae productoras de BLEE, presentaron pulsotipos totalmente distintos, por lo que los porcentajes de similitud fueron bajos (menor al 80%), descartando una posible relación clonal entre ellas; esto concuerda con lo expresado por otros autores [8,25,28].

A pesar de que la mayoría de las cepas de K. pneumoniae productoras de BLEE presentaron patrones de bandas totalmente distintos, se encontró que dos aislados del servicio de Medicina I mostraron pulsotipos indistinguibles entre sí, ambos con el mismo fenotipo de resistencia (fenotipo I). Estos aislados fueron obtenidos a partir de pacientes hospitalizados durante el mismo período de tiempo y en habitaciones contiguas. La presencia de microorganismos infectantes indistinguibles en ambos pacientes podría deberse principalmente a la transmisión de la bacteria entre pacientes de ese servicio, siendo posiblemente las manos del personal de salud la principal vía involucrada; sin embargo, también el contacto entre pacientes del mismo servicio de hospitalización y los objetos que son compartidos en una misma habitación, pueden estar implicados en el paso de bacterias de un paciente a otro. Esa permanencia de K. pneumoniae en las manos del personal de salud y en el ambiente hospitalario, podría deberse a diferentes propiedades y características de esta bacteria, entre las que se encuentran su capacidad de resistir a la desecación en el medio ambiente y la de sobrevivir en la piel debido a su cápsula hidrófila, que además protege a la bacteria de la fagocitosis por los polimorfonucleares, macrófagos y de los diversos factores bactericidas del hospedero [29-32].

En conclusión, no se encontró diseminación clonal de K. pneumoniae productora de BLEE entre pacientes adultos hospitalizados en el CHRP durante el período marzo-junio de 2011; sin embargo, se pudo constatar que hubo transmisión de este microorganismo entre dos pacientes del servicio de Medicina I.

Agradecimientos

Esta investigación fue parcialmente financiada con recursos provenientes del proyecto de investigación CI-5-0-40605-1535-09 del Consejo de Investigación de la Universidad de Oriente, Venezuela.

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